La seduta di Shiatsu avviene tra un operatore (detto Tori) e un ricevente (detto Uke). La sua durata complessiva è di circa un'ora e prevede:
- 10-15 min di colloquio iniziale
- 45-50 min di trattamento su un materassino di basso spessore (detto futon), sedia o lettino
- 10-15 min di colloquio finale
Il trattamento avviene senza contatto diretto pelle su pelle ma sempre attraverso gli indumenti o teli monouso. Il ricevente è pertanto invitato a indossare vestiti comodi, preferibilmente realizzati con tessuti naturali.